Քաղաքն իր անվանումը ստացել է ի պատիվ Էռնան Կորտեսի, որը 1524 թվականին այդ վայրում հիմնեց «Լա-Նատիվիդադ» քաղաքը։ 1533 թվականին հնդկացիները ոչնչացրին քաղաքը։ Ավելի ուշ՝ 1536 թվականին Պեդրո դե Ալվարադոն հիմնեց նոր քաղաք, որը ստացավ «Պուերտո-Կաբալոս» անվանումը[1]։ Արդեն 1869 թվականին քաղաքը վերանվանվեց Պուերտո-Կորտես։
Պուերտո Կորտեսը ֆուտբոլային թիմի ծննդավայրն է, որը հայտնի է որպես Պլատենսե անունով։ 1966 թվականին նվաճել է Հոնդուրասի ֆուտբոլի առաջին առաջնությունը։ 2001 թվականին թիմը նվաճել է իր երկրորդ ազգային առաջնությունը։ Նրանք իրենց տնային հանդիպումները խաղում են Էստադիո Էքսելսիոր մարզադաշտում։ "Աթլետիկո Պորտուարիոն" կարճ ժամանակ անց դարձավ ևս մեկ ֆուտբոլային ակումբ, որը տեղակայված է այս քաղաքում։