Լիգանդ (կենսաքիմիա)

Վիքիպեդիայից՝ ազատ հանրագիտարանից
Միոգլոբին (կապույտ) իր լիգանդ հեմով (նարնջագույն) կապված:

Կենսաքիմիայի և դեղագիտության մեջ լիգանդը նյութ է, որը կենսամոլեկուլի հետ կոմպլեքս է կազմում՝ կենսաբանական նպատակին ծառայելու համար։ Ստուգաբանությունը բխում է լատիներեն ligare-ից, որը նշանակում է «կապել»։ Սպիտակուց-լիգանդ կապելու դեպքում լիգանդը սովորաբար մոլեկուլ է, որն ազդանշան է արտադրում՝ կապվելով թիրախային սպիտակուցի մի տեղամասի հետ։ Կապը սովորաբար հանգեցնում է թիրախային սպիտակուցի կոնֆորմացիոն իզոմերիզմի (կոնֆորմացիայի) փոփոխության։ ԴՆԹ-լիգանդ կապող ուսումնասիրություններում լիգանդը կարող է լինել փոքր մոլեկուլ, իոն[1] կամ սպիտակուց[2], որը կապվում է ԴՆԹ-ի կրկնակի պարույրին։ Լիգանդի և կապող գործընկերոջ հարաբերությունը լիցքի, հիդրոֆոբության և մոլեկուլային կառուցվածքի ֆունկցիա է։

Կապը տեղի է ունենում միջմոլեկուլային ուժերի միջոցով, ինչպիսիք են իոնային կապերը, ջրածնային կապերը և Վան դեր Վալսի ուժերը։ Ասոցիացիան կամ միացումը իրականում շրջելի դիսոցման միջոցով։ Չափելիորեն անդառնալի կովալենտային կապը լիգանդի և թիրախային մոլեկուլի միջև գրեթե չի հանդիպում կենսաբանական համակարգերում։ Ի տարբերություն մետաղօրգանական և անօրգանական քիմիայի մեջ լիգանդի սահմանման, կենսաքիմիայում երկիմաստ է, թե արդյոք լիգանդն ընդհանրապես կապվում է մետաղական տեղամասում, ինչպես դա տեղի է ունենում հեմոգլոբինի դեպքում։ Ընդհանուր առմամբ, լիգանդի սահմանումը համատեքստային է այն առումով, թե ինչ տեսակի կապ է նկատվել։

Լիգանդի միացումը ընկալիչ սպիտակուցին փոխում է կոնֆորմացիան՝ ազդելով դրա եռաչափ ձևի վրա։ Ռեցեպտորային սպիտակուցի կոնֆորմացիան կազմում է ֆունկցիոնալ վիճակը։ Լիգանդները ներառում են սուբստրատներ, ինհիբիտորներ, ակտիվացնողներ, ազդանշանային լիպիդներ և նյարդային հաղորդիչներ։ Կապակցման արագությունը կոչվում է մերձեցում, և այս չափումը բնորոշում է ազդեցության միտումը կամ ուժը։ Կապակցման ուժը ակտուալացվում է ոչ միայն հյուրընկալող-հյուր փոխազդեցությունների, այլ նաև լուծողական էֆեկտների միջոցով, որոնք կարող են գերիշխող, ստերիկ դեր խաղալ, ինչը հանգեցնում է ոչ կովալենտային կապի առաջացմանը լուծույթում[3]։ Լուծիչը քիմիական միջավայր է ապահովում լիգանդի և ընկալիչի համար՝ հարմարվելու և այդպիսով ընդունելու կամ մերժելու միմյանց որպես գործընկերներ։

Ռադիոլիգանդները ռադիոիզոտոպներով պիտակավորված միացություններ են, որոնք օգտագործվում են որպես հետագծողներ PET հետազոտություններում և կապակցման ուսումնասիրությունների համար։

Ընկալիչ/լիգանդ կապակցման ուժը[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

Լիգանդների փոխազդեցությունը նրանց կապակցման վայրերի հետ կարելի է բնութագրել կապի ուժի տեսանկյունից։ Ընդհանուր առմամբ, բարձր կապակցման ուժ ունեցող լիգանդի կապակցումը առաջանում է ավելի մեծ գրավող ուժերից՝ լիգանդի և նրա ընկալիչի միջև, մինչդեռ ցածր կապակցման ուժ ունեցող լիգանդի կապը ներառում է ավելի քիչ գրավող ուժ։ Ընդհանուր առմամբ, բարձր ուժով կապակցումը հանգեցնում է ընկալիչի ավելի մեծ կապվածության իր լիգանդի կողմից, քան ցածր կապակցման դեպքում. կապման ժամանակը (ընկալիչ-լիգանդ կոմպլեքսի կյանքի տևողությունը) փոխկապակցված չէ։ Լիգանդների բարձր ուժով ընկալիչների հետ կապելը հաճախ ֆիզիոլոգիապես կարևոր է, երբ կապող էներգիայի մի մասը կարող է օգտագործվել ընկալիչի կոնֆորմացիոն փոփոխություն առաջացնելու համար, ինչը հանգեցնում է փոխազդման փոփոխության, օրինակ՝ կապված իոնային անցուղու կամ ֆերմենտի։ Լիգանդը, որը կարող է կապվել և փոխել ֆիզիոլոգիական արձագանք առաջացնող ընկալիչի ֆունկցիան, կոչվում է ընկալիչի ագոնիստ։ Լիգանդները, որոնք կապվում են ընկալիչի հետ, բայց չեն կարողանում ակտիվացնել ֆիզիոլոգիական արձագանքը, ընկալիչների անտագոնիստներ են։

Ագոնիստների կապը ընկալիչի հետ կարող է բնութագրվել ինչպես ֆիզիոլոգիական արձագանքի (այսինքն՝ արդյունավետության) և այնպես էլ ագոնիստի կոնցենտրացիայի տեսանկյունից, որը անհրաժեշտ է ֆիզիոլոգիական արձագանք ստեղծելու համար (հաճախ չափվում է որպես EC50, կոնցենտրացիան, որը պահանջվում է կիսով չափ առավելագույն պատասխան ստանալու համար)։ Բարձր ուժի հարաբերակցությամբ լիգանդի կապը ենթադրում է, որ լիգանդի համեմատաբար ցածր կոնցենտրացիան բավարար է լիգանդի կապող տեղամասը առավելագույնս զբաղեցնելու և ֆիզիոլոգիական արձագանք առաջացնելու համար։ Ռեցեպտորների մերձեցումը չափվում է արգելակման հաստատունով կամ Ki արժեքով, այն կոնցենտրացիան, որն անհրաժեշտ է ընկալիչի 50%-ը զբաղեցնելու համար։ Լիգանդների մերձեցումները առավել հաճախ չափվում են անուղղակիորեն որպես IC50 արժեք մրցակցային կապող փորձից, որտեղ որոշվում է լիգանդի կոնցենտրացիան, որն անհրաժեշտ է թիրախային լիգանդի ֆիքսված կոնցենտրացիայի 50%-ը տեղակալելու համար։ Ki արժեքը կարելի է գնահատել IC50-ից Չենգ Պրուսոֆի հավասարման միջոցով։ Լիգանդի հարաբերակցությունը կարող է նաև ուղղակիորեն չափվել որպես դիսոցման հաստատուն (Kd)՝ օգտագործելով այնպիսի մեթոդներ, ինչպիսիք են ֆլյուորեսցենտային մարումը, իզոթերմային տիտրման կալորաչափությունը կամ մակերեսային պլազմոնային ռեզոնանսը[4]։

Երկու ագոնիստներ, որոնք ունեն նմանատիպ կապակցման ուժ
Երկու լիգանդներ՝ տարբեր ընկալիչների կապակցման ուժով

Ցածր ուժով մերձեցման կապը (բարձր Ki-ի մակարդակը) ենթադրում է, որ լիգանդի համեմատաբար բարձր կոնցենտրացիան պահանջվում է նախքան կապի տեղը առավելագույնս զբաղված լինելը և լիգանդի նկատմամբ առավելագույն ֆիզիոլոգիական արձագանքը ձեռք բերելը։ Աջ կողմում ցուցադրված օրինակում երկու տարբեր լիգանդներ կապվում են նույն ընկալիչի միացման վայրին։ Ցուցադրված ագոնիստներից միայն մեկը կարող է առավելագույնս խթանել ընկալիչը և, հետևաբար, կարող է սահմանվել որպես լիարժեք ագոնիստ։ Ագոնիստը, որը կարող է միայն մասամբ ակտիվացնել ֆիզիոլոգիական արձագանքը, կոչվում է մասնակի ագոնիստ։ Այս օրինակում կոնցենտրացիան, որի դեպքում ամբողջական ագոնիստը (կարմիր կորը) կարող է կիսով չափ ակտիվացնել ընկալիչը, մոտավորապես 5 x 10−9 մոլար է (nM = նանոմոլար)։

Կապակցման ուժը առավել հաճախ որոշվում է ռադիոպիտակավորված լիգանդի միջոցով, որը հայտնի է որպես պիտակավորված լիգանդ։ Հոմոլոգ մրցակցային կապի փորձերը ներառում են պարտադիր մրցակցություն պիտակավորված լիգանդի և չպիտակավորված լիգանդի միջև[5]։ Իրական ժամանակի վրա հիմնված մեթոդները, որոնք հաճախ առանց պիտակավորման են, ինչպիսիք են մակերևութային պլազմոնային ռեզոնանսը, երկբևեռացման ինտերֆերոմետրիան և բազմապարամետրիկ մակերևութային պլազմոնային ռեզոնանսը (MP-SPR), կարող են ոչ միայն քանակականացնել կապը կոնցենտրացիայի վրա հիմնված անալիզներից. այլ նաև ասոցիացման և դիսոցման կինետիկայից, իսկ ավելի ուշ դեպքերում՝ կապակցման արդյունքում առաջացած կոնֆորմացիոն փոփոխությունից։ MP-SPR-ը նաև հնարավորություն է տալիս չափումներ կատարել աղի բարձր դիսոցման բուֆերներում՝ շնորհիվ եզակի օպտիկական տեղադրման։ Մշակվել է միկրոմասշտաբային ջերմաֆորեզ (MST), անշարժացումից զերծ մեթոդ[6]։ Այս մեթոդը թույլ է տալիս որոշել կապակցման ուժը՝ առանց լիգանդի մոլեկուլային քաշի սահմանափակման[7]։

Վիճակագրական մեխանիկայի օգտագործման համար լիգանդ-ընկալիչ կապող ուժի քանակական ուսումնասիրության համար տե՛ս կոնֆիգուրացիոն բաժանման ֆունկցիայի մասին համապարփակ հոդվածը[8]։

Դեղորայքի արդյունավետությունը և կապակցման ուժը[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

Միայն կապակցված ուժի տվյալները չեն որոշում դեղամիջոցի ընդհանուր ուժը։ Արդյունավետությունը և՛ կապակցման ուժի, և՛ լիգանդի արդյունավետության բարդ փոխազդեցության արդյունք է։ Լիգանդի արդյունավետությունը վերաբերում է թիրախային ընկալիչին միանալուց հետո լիգանդի կենսաբանական արձագանք առաջացնելու կարողությանը և այս պատասխանի քանակական մեծությանը։ Այս արձագանքը կարող է լինել որպես ագոնիստ, անտագոնիստ կամ հակադարձ ագոնիստ՝ կախված արտադրված ֆիզիոլոգիական արձագանքից[9]։

Ընտրովի և ոչ ընտրովի[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

Ընտրովի լիգանները հակված են կապվելու շատ սահմանափակ տեսակի ընկալիչների, մինչդեռ ոչ սելեկտիվ լիգանները կապվում են մի քանի տեսակի ընկալիչների հետ։ Սա կարևոր դեր է խաղում դեղաբանության մեջ, որտեղ ոչ սելեկտիվ դեղամիջոցները հակված են ավելի շատ անբարենպաստ ազդեցություն ունենալ, քանի որ նրանք կապվում են մի քանի այլ ընկալիչների հետ, ի հավելումն ցանկալի արդյունքի։

Հիդրոֆոբ լիգանդներ[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

Հիդրոֆոբ լիգանդների համար (օրինակ՝ PIP2) կոմպլեքսում հիդրոֆոբ սպիտակուցի հետ (օրինակ՝ լիպիդներով փակված իոնային անցուղիներ), կապը որոշելը բարդանում է ոչ հատուկ հիդրոֆոբ փոխազդեցությամբ։ Ոչ հատուկ հիդրոֆոբ փոխազդեցությունները կարող են հաղթահարվել, երբ լիգանդի մերձեցումը բարձր է[10]։ Օրինակ, PIP2-ը կապում է PIP2 փակ իոնային անցուղիների հետ բարձր ուժ ունեցող կապով։

Երկվալենտ լիգանդ[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

Երկվալենտ լիգանդները կազմված են դեղամիջոցների նման երկու մոլեկուլներից (ֆարմակոֆորներ կամ լիգանդներ), որոնք միացված են չեզոք կապակցիչով։ Գոյություն ունեն տարբեր տեսակի երկվալենտ լիգանդներ և հաճախ դասակարգվում են՝ հիմնվելով այն բանի վրա, թե ինչ են ֆարմակոֆորները թիրախավորում։ Հոմոերկվալենտ լիգանդները թիրախավորում են նույն ընկալիչների երկու տեսակները[11]։ Հետերոերկվալենտ լիգանդները ուղղված են ընկալիչների երկու տարբեր տեսակների։ Բիտոպիկ լիգանդները ուղղված են օրթոստերիկ կապակցման վայրերին և ալոստերիկ կապող վայրերին նույն ընկալիչի վրա[12]։ Գիտական հետազոտություններում երկվալենտ լիգանդները օգտագործվել են ընկալիչների դիմերների ուսումնասիրության և դրանց հատկությունները ուսումնասիրելու համար։ Լիգանդների այս դասը ստեղծվել է Ֆիլիպ Ս. Պորտոգեզեի և գործընկերների կողմից՝ ուսումնասիրելով օփիոիդային ընկալիչների համակարգը[13][14][15]։ Երկվալենտ լիգանդների մասին նաև վաղ հաղորդվել է Մայքլ Քոնի և գոնադոտրոպին ազատող հորմոնի ընկալիչի աշխատակիցների կողմից[16][17]։ Այս վաղ զեկույցներից ի վեր բազմաթիվ երկվալենտ լիգաններ են հաղորդվել տարբեր G սպիտակուցով զուգակցված ընկալիչների (GPCR) համակարգերի համար, ներառյալ կանաբինոիդ[18], սերոտոնին[19][20], օքսիտոցին[21] և մելանոկորտին ընկալիչ համակարգերը[22][23][24], ինչպես նաև GPCR-LIC համակարգերի համար (D2 և nACh ընկալիչները)[11]։

Երկվալենտ լիգանդները սովորաբար հակված են ավելի մեծ լինել, քան իրենց միավալենտ տեսակները, և, հետևաբար, «դեղորայքային» չեն, ինչպես Լիպինսկու հինգ կանոնում։ Շատերը կարծում են, որ սա սահմանափակում է դրանց կիրառելիությունը կլինիկական պայմաններում[25][26]։ Չնայած այս համոզմունքներին, եղել են բազմաթիվ լիգաններ, որոնք արձանագրել են կենդանիների նախակլինիկական հաջող հետազոտություններ[21][23][24][27][28][29]։ Հաշվի առնելով, որ որոշ երկվալենտ լիգանդներ կարող են ունենալ բազմաթիվ առավելություններ՝ համեմատած իրենց միավալենտ տեսակների հետ (ինչպիսիք են հյուսվածքների ընտրողականությունը, կապի ուժի բարձրացումը և հզորությունը կամ արդյունավետությունը), երկվալենտները կարող են նաև որոշակի կլինիկական առավելություններ առաջարկել։

Միա- և բազմակապ լիգանդներ[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

Սպիտակուցների լիգանդները կարող են բնութագրվել նաև սպիտակուցային շղթաների քանակով, որոնք նրանք կապում են։ «Մոնոդեսմիկ» լիգանդները (μόνος՝ միայնակ, δεσμός՝ կապող)[30] լիգանդներ են, որոնք կապում են մեկ սպիտակուցային շղթա, մինչդեռ «պոլիդեմիկ» լիգանները (πολοί՝ շատ) հաճախակի են սպիտակուցային կոմպլեքսներում, և այն լիգանդներ են, որոնք սովորաբար կապում են մեկից ավելի սպիտակուցային շղթա սպիտակուցային միջերեսներում կամ մոտ։ Վերջին հետազոտությունները ցույց են տալիս, որ լիգանդների տեսակը և կապող տեղանքի կառուցվածքը խորը հետևանքներ ունեն սպիտակուցային կոմպեքսների էվոլյուցիայի, ֆունկցիայի, ալոստերիայի և երկրաչափության վրա[31][32]։

Կապերի ուսումնասիրման մեթոդներ[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

Սպիտակուց-լիգանդ փոխազդեցությունների ուսումնասիրման հիմնական մեթոդներն են հիդրոդինամիկ և կալորիմետրիկ մեթոդները, ինչպես նաև հիմնական սպեկտրոսկոպիկ և կառուցվածքային մեթոդները, ինչպիսիք են.

Այլ տեխնիկան ներառում է. y, էլեկտրոնային պարամագնիսական ռեզոնանս, միկրոմասշտաբային ջերմաֆորեզ, switchSENSE:

Գերհամակարգիչների և անհատական համակարգիչների հաշվողական հզորության կտրուկ աճը հնարավորություն է տվել ուսումնասիրել սպիտակուց-լիգանդ փոխազդեցությունները նաև հաշվողական քիմիայի միջոցով։ Օրինակ, ավելի քան մեկ միլիոն սովորական ԱՀ-ից բաղկացած համաշխարհային ցանցը օգտագործվել է քաղցկեղի հետազոտության համար grid.org նախագծում, որն ավարտվել է 2007թ. ապրիլին։, Հաշվարկեք Քաղցկեղի դեմ և Folding@Home:

Այլ տեխնիկաները ներառում են՝ ֆլուորեսցենտային ինտենսիվություն, երկմոլեկուլային ֆլուորեսցենտային կոմպլեմենացիա, FRET (լյումինեսցենտային ռեզոնանսային էներգիայի փոխանցում) / FRET մարող մակերեսային պլազմոնային ռեզոնանս, կենսաշերտային ինտերֆերաչափություն Անուղղակի կոիմունային նստվածքային ELISA, հավասարակշռության դիալիզ, գելային էլեկտրոֆորեզ, ֆլուորեսցենտային բևեռացման անիզոտրոպիա, էլեկտրոնների պարամագնիսական ռեզոնանս, միկրոմաշտաբի ջերմաֆորեզ, switchSENSE:

Գերհամակարգիչների և անհատական համակարգիչների հաշվողական հզորության կտրուկ աճը հնարավորություն է տվել ուսումնասիրել սպիտակուց-լիգանդ փոխազդեցությունները նաև հաշվողական քիմիայի միջոցով։ Օրինակ, ավելի քան մեկ միլիոն սովորական ԱՀ-ից բաղկացած համաշխարհային ցանցը օգտագործվել է քաղցկեղի հետազոտության համար grid.org նախագծում, որն ավարտվել է 2007թ. ապրիլին։ Grid.org-ին հաջողվել է նմանատիպ նախագծեր, ինչպիսիք են World Community Grid-ը, Human Proteome Folding Project-ը, Compute Against Cancer-ը և Folding@Home-ը։

Տես նաև[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

Ծանոթագրություններ[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

  1. ↑ Teif VB (October 2005). «Ligand-induced DNA condensation: choosing the model». Biophysical Journal. 89 (4): 2574–87. Bibcode:2005BpJ....89.2574T. doi:10.1529/biophysj.105.063909. PMC 1366757. PMID 16085765.
  2. ↑ Teif VB, Rippe K (October 2010). «Statistical-mechanical lattice models for protein-DNA binding in chromatin». Journal of Physics: Condensed Matter. 22 (41): 414105. arXiv:1004.5514. Bibcode:2010JPCM...22O4105T. doi:10.1088/0953-8984/22/41/414105. PMID 21386588. S2CID 103345.
  3. ↑ Baron R, Setny P, McCammon JA (September 2010). «Water in cavity-ligand recognition». Journal of the American Chemical Society. 132 (34): 12091–7. doi:10.1021/ja1050082. PMC 2933114. PMID 20695475.
  4. ↑ «The difference between Ki, Kd, IC50, and EC50 values». The Science Snail. 2019 թ․ դեկտեմբերի 31.
  5. ↑ See Homologous competitive binding curves Արխիվացված 2007-12-19 Wayback Machine, A complete guide to nonlinear regression, curvefit.com.
  6. ↑ Baaske P, Wienken CJ, Reineck P, Duhr S, Braun D (March 2010). «Optical thermophoresis for quantifying the buffer dependence of aptamer binding». Angewandte Chemie. 49 (12): 2238–41. doi:10.1002/anie.200903998. PMID 20186894.
  7. ↑ Wienken CJ, Baaske P, Rothbauer U, Braun D, Duhr S (October 2010). «Protein-binding assays in biological liquids using microscale thermophoresis». Nature Communications. 1 (7): 100. Bibcode:2010NatCo...1..100W. doi:10.1038/ncomms1093. PMID 20981028.
  8. ↑ Vu-Quoc, L., Configuration integral (statistical mechanics), 2008. this wiki site is down; see this article in the web archive on 2012 April 28.
  9. ↑ Kenakin TP (November 2006). A pharmacology primer: theory, applications, and methods. Academic Press. էջ 79. ISBN 978-0-12-370599-0.
  10. ↑ Cabanos, C; Wang, M; Han, X; Hansen, SB (2017 թ․ օգոստոսի 8). «A Soluble Fluorescent Binding Assay Reveals PIP2 Antagonism of TREK-1 Channels». Cell Reports. 20 (6): 1287–1294. doi:10.1016/j.celrep.2017.07.034. PMC 5586213. PMID 28793254.
  11. ↑ 11,0 11,1 Matera, Carlo; Pucci, Luca; Fiorentini, Chiara; Fucile, Sergio; Missale, Cristina; Grazioso, Giovanni; Clementi, Francesco; Zoli, Michele; De Amici, Marco (2015 թ․ օգոստոսի 28). «Bifunctional compounds targeting both D2 and non-α7 nACh receptors: Design, synthesis and pharmacological characterization». European Journal of Medicinal Chemistry. 101: 367–383. doi:10.1016/j.ejmech.2015.06.039. PMID 26164842.
  12. ↑ Matera, Carlo; Flammini, Lisa; Quadri, Marta; Vivo, Valentina; Ballabeni, Vigilio; Holzgrabe, Ulrike; Mohr, Klaus; De Amici, Marco; Barocelli, Elisabetta (2014 թ․ մարտի 21). «Bis(ammonio)alkane-type agonists of muscarinic acetylcholine receptors: Synthesis, in vitro functional characterization, and in vivo evaluation of their analgesic activity». European Journal of Medicinal Chemistry. 75: 222–232. doi:10.1016/j.ejmech.2014.01.032. PMID 24534538.
  13. ↑ Erez M, Takemori AE, Portoghese PS (July 1982). «Narcotic antagonistic potency of bivalent ligands which contain beta-naltrexamine. Evidence for bridging between proximal recognition sites». Journal of Medicinal Chemistry. 25 (7): 847–9. doi:10.1021/jm00349a016. PMID 7108900.
  14. ↑ Portoghese PS, Ronsisvalle G, Larson DL, Yim CB, Sayre LM, Takemori AE (1982). «Opioid agonist and antagonist bivalent ligands as receptor probes». Life Sciences. 31 (12–13): 1283–6. doi:10.1016/0024-3205(82)90362-9. PMID 6292615.
  15. ↑ Portoghese PS, Akgün E, Lunzer MM (January 2017). «Heteromer Induction: An Approach to Unique Pharmacology?». ACS Chemical Neuroscience. 8 (3): 426–428. doi:10.1021/acschemneuro.7b00002. PMID 28139906.
  16. ↑ Blum JJ, Conn PM (December 1982). «Gonadotropin-releasing hormone stimulation of luteinizing hormone release: A ligand-receptor-effector model». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 79 (23): 7307–11. Bibcode:1982PNAS...79.7307B. doi:10.1073/pnas.79.23.7307. JSTOR 13076. PMC 347328. PMID 6296828.
  17. ↑ Conn PM, Rogers DC, Stewart JM, Niedel J, Sheffield T (April 1982). «Conversion of a gonadotropin-releasing hormone antagonist to an agonist». Nature. 296 (5858): 653–5. Bibcode:1982Natur.296..653C. doi:10.1038/296653a0. PMID 6280058. S2CID 4303982.
  18. ↑ Nimczick M, Pemp D, Darras FH, Chen X, Heilmann J, Decker M (August 2014). «Synthesis and biological evaluation of bivalent cannabinoid receptor ligands based on hCB₂R selective benzimidazoles reveal unexpected intrinsic properties». Bioorganic & Medicinal Chemistry. 22 (15): 3938–46. doi:10.1016/j.bmc.2014.06.008. PMID 24984935.
  19. ↑ Soulier JL, Russo O, Giner M, Rivail L, Berthouze M, Ongeri S, Maigret B, Fischmeister R, Lezoualc'h F, Sicsic S, Berque-Bestel I (October 2005). «Design and synthesis of specific probes for human 5-HT4 receptor dimerization studies» (PDF). Journal of Medicinal Chemistry. 48 (20): 6220–8. doi:10.1021/jm050234z. PMID 16190749.
  20. ↑ Russo O, Berthouze M, Giner M, Soulier JL, Rivail L, Sicsic S, Lezoualc'h F, Jockers R, Berque-Bestel I (September 2007). «Synthesis of specific bivalent probes that functionally interact with 5-HT(4) receptor dimers». Journal of Medicinal Chemistry. 50 (18): 4482–92. doi:10.1021/jm070552t. PMID 17676726.
  21. ↑ 21,0 21,1 Busnelli M, Kleinau G, Muttenthaler M, Stoev S, Manning M, Bibic L, Howell LA, McCormick PJ, Di Lascio S, Braida D, Sala M, Rovati GE, Bellini T, Chini B (August 2016). «Design and Characterization of Superpotent Bivalent Ligands Targeting Oxytocin Receptor Dimers via a Channel-Like Structure». Journal of Medicinal Chemistry. 59 (15): 7152–66. doi:10.1021/acs.jmedchem.6b00564. PMID 27420737.
  22. ↑ Lensing CJ, Adank DN, Wilber SL, Freeman KT, Schnell SM, Speth RC, Zarth AT, Haskell-Luevano C (February 2017). «A Direct in Vivo Comparison of the Melanocortin Monovalent Agonist Ac-His-DPhe-Arg-Trp-NH2 versus the Bivalent Agonist Ac-His-DPhe-Arg-Trp-PEDG20-His-DPhe-Arg-Trp-NH2: A Bivalent Advantage». ACS Chemical Neuroscience. 8 (6): 1262–1278. doi:10.1021/acschemneuro.6b00399. PMC 5679024. PMID 28128928.
  23. ↑ 23,0 23,1 Xu L, Josan JS, Vagner J, Caplan MR, Hruby VJ, Mash EA, Lynch RM, Morse DL, Gillies RJ (December 2012). «Heterobivalent ligands target cell-surface receptor combinations in vivo». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109 (52): 21295–300. Bibcode:2012PNAS..10921295X. doi:10.1073/pnas.1211762109. JSTOR 42553664. PMC 3535626. PMID 23236171.
  24. ↑ 24,0 24,1 Lensing CJ, Freeman KT, Schnell SM, Adank DN, Speth RC, Haskell-Luevano C (April 2016). «An in Vitro and in Vivo Investigation of Bivalent Ligands That Display Preferential Binding and Functional Activity for Different Melanocortin Receptor Homodimers». Journal of Medicinal Chemistry. 59 (7): 3112–28. doi:10.1021/acs.jmedchem.5b01894. PMC 5679017. PMID 26959173.
  25. ↑ Shonberg J, Scammells PJ, Capuano B (June 2011). «Design strategies for bivalent ligands targeting GPCRs». ChemMedChem. 6 (6): 963–74. doi:10.1002/cmdc.201100101. PMID 21520422. S2CID 10561038.
  26. ↑ Berque-Bestel I, Lezoualc'h F, Jockers R (December 2008). «Bivalent ligands as specific pharmacological tools for G protein-coupled receptor dimers». Current Drug Discovery Technologies. 5 (4): 312–8. doi:10.2174/157016308786733591. PMID 19075611.
  27. ↑ Akgün E, Javed MI, Lunzer MM, Powers MD, Sham YY, Watanabe Y, Portoghese PS (November 2015). «Inhibition of Inflammatory and Neuropathic Pain by Targeting a Mu Opioid Receptor/Chemokine Receptor5 Heteromer (MOR-CCR5)». Journal of Medicinal Chemistry. 58 (21): 8647–57. doi:10.1021/acs.jmedchem.5b01245. PMC 5055304. PMID 26451468.
  28. ↑ Smeester BA, Lunzer MM, Akgün E, Beitz AJ, Portoghese PS (November 2014). «Targeting putative mu opioid/metabotropic glutamate receptor-5 heteromers produces potent antinociception in a chronic murine bone cancer model». European Journal of Pharmacology. 743: 48–52. doi:10.1016/j.ejphar.2014.09.008. PMC 4259840. PMID 25239072.
  29. ↑ Daniels DJ, Lenard NR, Etienne CL, Law PY, Roerig SC, Portoghese PS (December 2005). «Opioid-induced tolerance and dependence in mice is modulated by the distance between pharmacophores in a bivalent ligand series». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 102 (52): 19208–13. Bibcode:2005PNAS..10219208D. doi:10.1073/pnas.0506627102. JSTOR 4152590. PMC 1323165. PMID 16365317.
  30. ↑ Abrusan G, Marsh JA (2019). «Ligand Binding Site Structure Shapes Folding, Assembly and Degradation of Homomeric Protein Complexes». Journal of Molecular Biology. 431 (19): 3871–3888. doi:10.1016/j.jmb.2019.07.014. PMC 6739599. PMID 31306664.
  31. ↑ Abrusan G, Marsh JA (2018). «Ligand Binding Site Structure Influences the Evolution of Protein Complex Function and Topology». Cell Reports. 22 (12): 3265–3276. doi:10.1016/j.celrep.2018.02.085. PMC 5873459. PMID 29562182.
  32. ↑ Abrusan G, Marsh JA (2019). «Ligand-Binding-Site Structure Shapes Allosteric Signal Transduction and the Evolution of Allostery in Protein Complexes». Molecular Biology and Evolution. 36 (8): 1711–1727. doi:10.1093/molbev/msz093. PMC 6657754. PMID 31004156.

Արտաքին հղումներ[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

  • BindingDB, a public database of measured protein-ligand binding affinities.
  • BioLiP, a comprehensive database for ligand-protein interactions.
Ստացված է «https://hy.wikipedia.org/w/index.php?title=Լիգանդ_(կենսաքիմիա)&oldid=9483742» էջից