Աշխատությունները վերաբերում են բարոյագիտության տեսության և պատմության հարցերին։ Խաչատրյանը ստեղծել է փիլիսոփայական գիտելիքի յուրահատկության ինքնուրույն հայեցակարգ։
Кандидатская диссертация - «Возникновение, развитие и социальная сущность эгоизма и теорий эгоизма» (1971).
Докторская диссертация - «Индивидуализм, личность и класс. Этико-психол. аспекты проблемы» (1983).
Принцип индивидуализма в этических теориях. Монография. Ереван, 1978.
Формирование и развитие коллективизма. Монография. Ереван, 1979.
Индивидуализм и деморализация класса и личности (Опыт этико-философского исследования). Монография. Ереван, 1981.
Природа эгоизма, альтруизма и человеческая природа. Ереван, 1982.
Проблема гуманизма в раннегреческой поэзии. Этико-философский аспект. Монография. Ереван, 1989.
У истоков проблемы гуманизма в европейской мысли. Ереван, 1989.
Логика. Волгоград. 2004.
Краткое введение в историю и философию биологии. Монография. Волгоград, 2005.
Эмпирическое, теоретическое и метатеоретическое в философии науки. Монография. Волгоград, 2006.
Философия как стремление к мудрости в зеркале философской рефлексии. Монография. Волгоград, 2006.
Социально-гуманитарные науки в системе сельскохозяйственного образования. Монография. Авторский коллектив: Хачатрян А. А. (руководитель авт. колл.), Сафин Ф. М., Рысаева Г. Р. и др. Казань: ФГБОУ ВПО «КГАВМ им. Н. Э. Баумана», 2012.
История и философия науки. Учебно-методический комплекс для аспирантов и соискателей биологических и ветеринарных специальностей. Казань, 2015.
Философия Биологии: Основные проблемы, понятия, принципы Казань, 2017.