ԴՆԹ լիգազ

Վիքիպեդիայից՝ ազատ հանրագիտարանից
Jump to navigation Jump to search
ԴՆԹ լիգազ
DNA Repair.jpg Քրոմոսոմալ վնասվածքը կարգավորող ԴՆԹ լիգազ
Տեսակֆերմենտ
Գենետիկ հարաբերությունHomo sapiens
Բնորոշիչներ
ՖՀ համար6.5.1.1
CAS համար9015-85-4
Տվյալներ
IntEnzIntEnz կայքում
BRENDABRENDA կայքում
ExPASyNiceZyme կայքում
KEGGKEGG կայքում
MetaCycմետաբոլիզմ
PRIAMPRIAM կայքում
Protein Data BankRCSB PDB PDBe PDBsum
Գենի օնտոլոգիաAmiGO / EGO
Լիգազ I, ԴՆԹ, ԱԵՖ-կախյալ
DNA Ligase.jpg
Բնորոշիչներ
ՍիմվոլLIG1
Entrez3978
HUGO6598
OMIM126391
RefSeqNM_000234
UniProtP18858
Այլ տվյալներ
ԼոկուսՔրոմ. 19 {{{Arm}}}{{{Band}}}{{{LocusSupplementaryData}}}
Լիգազ III, ԴՆԹ, ԱԵՖ-կախյալ
Բնորոշիչներ
ՍիմվոլLIG3
Entrez3980
HUGO6600
OMIM600940
RefSeqNM_002311
UniProtP49916
Այլ տվյալներ
ԼոկուսՔրոմ. 17 q11.2-q12
Լիգազ IV, ԴՆԹ, ԱԵՖ-կախյալ
Բնորոշիչներ
ՍիմվոլLIG4
Entrez3981
HUGO6601
OMIM601837
RefSeqNM_002312
UniProtP49917
Այլ տվյալներ
ԼոկուսՔրոմ. 13 q33-q34

ԴՆԹ լիգազ (ՖՀ 6.5.1.1), ֆերմենտ, լիգազ, որը կատալիզում է ԴՆԹ-ի շղթաների միացումը՝ ֆոսֆոդիէսթերային կապերի առաջացմամբ[1]։

ԴՆԹ լիգազը օգտագործվում է ԴՆԹ ռեպարացիայի և ռեպլիկացիայի ժամանակ։ Բացի այդ՝ այն օգտագործվում է մոլեկուլային կենսաբանության մեջ, ռեկոմբինանտ ԴՆԹ-ի ստացման համար։

Առաջին անգամ ԴՆԹ լիգազ ստացվել և նկարագրվել է 1967 թվականին[2]։

Մեխանիզմ[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

ԴՆԹ լիգազի ազդման մեխանիզմն իր մեջ է ներառում երկու ֆոսֆոդիէսթերային կապերի առաջացումը նուկլեոտիդներից մեկի 3' հիդրօքսիլի և մյուսի 5' ֆոսֆատի միջև։ ԱԵՖ-ն անհրածեշտ է հետևյալ երեք պրոցեսներում

  1. ֆերմենտի ակտիվ կենտրոնում լիզինի մնացորդի ադենիլացում
  2. ԱՄՖ-ի փոխանցում 5' ֆոսֆատի մոտ
  3. ֆոսֆոդիէսթերային կապի առաջացում[3]

Ligation.svg

Տեսակներ[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

E. coli ԴՆԹ լիգազ[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

E. coli ԴՆԹ լիգազը կոդավորվում է lig գենով։ Շատ պրոկարիոտների մոտ ԴՆԹ լիգազը ստանում է էներգիա NAD-ից[4]։

T4 ԴՆԹ լիգազ[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

Բակտերիոֆագ T4-ից ստացված ԴՆԹ լիգազը հաճախ օգտագործվում է կենսաբանական լաբորատորիաներում[5][6]։

Կաթնասունների լիգազներ[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

Կաթնասունների մոտ կան հիմնականում չորս տիպի լիգազներ[4]՝LIG1, LIG2, LIG3, LIG4։

Տես նաև[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

Ծանոթագրություններ[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

  1. Pascal JM, O'Brien PJ, Tomkinson AE, Ellenberger T (November 2004)։ «Human DNA ligase I completely encircles and partially unwinds nicked DNA»։ Nature 432 (7016): 473–8։ PMID 15565146։ doi:10.1038/nature03082 
  2. Weiss B, Richardson CC (April 1967)։ «Enzymatic breakage and joining of deoxyribonucleic acid, I. Repair of single-strand breaks in DNA by an enzyme system from Escherichia coli infected with T4 bacteriophage»։ Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 57 (4): 1021–8։ PMC 224649։ PMID 5340583։ doi:10.1073/pnas.57.4.1021 
  3. Lehman IR (November 1974)։ «DNA ligase: structure, mechanism, and function»։ Science 186 (4166): 790–7։ PMID 4377758։ doi:10.1126/science.186.4166.790 
  4. 4,0 4,1 Foster JB, Slonczewski J (2010)։ Microbiology: An Evolving Science (Second ed.)։ New York: W. W. Norton & Company։ ISBN 0-393-93447-0 
  5. «Ligases»։ Enzyme Resources Guide։ Promega Corporation։ էջեր 8–14 
  6. Wilson RH, Morton SK, Deiderick H, Gerth ML, Paul HA, Gerber I, Patel A, Ellington AD, Hunicke-Smith SP, Patrick WM (July 2013)։ «Engineered DNA ligases with improved activities in vitro»։ Protein Eng. Des. Sel. 26 (7): 471–8։ PMID 23754529։ doi:10.1093/protein/gzt024 

Արտաքին հղումներ[խմբագրել | խմբագրել կոդը]