Կենսաինֆորմատիկա

Վիքիպեդիայից՝ ազատ հանրագիտարանից
Jump to navigation Jump to search

Կենսաինֆորմատիկան հանդիսանում է միջմասնագիտական ​​դաշտ, որը մշակում է կենսաբանական տվյալների ընկալման մեթոդներ և ծրագրային գործիքներ[1]։ Որպես գիտության միջդիսցիպլինար դաշտ, բիոինֆորմատիկան համատեղում է կենսաբանության, համակարգչային գիտության, տեղեկատվական ինժեներիայի, մաթեմատիկայի և վիճակագրության համար կենսաբանական տվյալների վերլուծության և մեկնաբանման համար: Կենսաինֆորմատիկան օգտագործվել է մաթեմատիկական և վիճակագրական մեթոդների կիրառմամբ կենսաբանական հարցումների սիլիկոնային վերլուծություններում: Կենսաինֆորմատիկան ինչպես կենսաբանական ուսումնասիրությունների մարմնի հովանավոր տերմինն է, որն օգտագործում է համակարգչային ծրագրավորումը՝ որպես մեթոդաբանության մաս, այնպես նաև հղում` «բազմամյա օգտագործման», մասնավորապես, գենոմիկայի բնագավառում: Կենսաինֆորմատիկայի ընդհանուր օգտագործումը ներառում է թեկնածուների գենների և առանձին նուկլեոտիդային պոլիմորֆիզմներ նույնականացումը: Հաճախ նման նույնականացումը կատարվում է հիվանդության գենային հիմքի, եզակի հարմարվողականության, ցանկալի հատկությունների (հատկապես գյուղատնտեսական տեսակների) կամ բնակչության միջև տարբերությունների ավելի լավ ընկալման նպատակով: Պակաս ֆորմալ ձևով, կենսաինֆորմատիկան նաև փորձում է հասկանալ նուկլեինաթթվի և սպիտակուցի հաջորդականությունների մեջ գտնվող կազմակերպական սկզբունքները, որոնք կոչվում են պրոտոմիկատներ:

Ներածություն[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

Կենսաինֆորմատիկան կենսաբանության բազմաթիվ ոլորտների կարևոր մասն է դարձել: Փորձարարական մոլեկուլային կենսաբանության մեջ, կենսաինֆորմատիկայի մեթոդները, ինչպիսիք են պատկերն ու ազդանշանը վերամշակելը, թույլ են տալիս հումքի մեծ քանակությամբ օգտակար արդյունքներ արդյունահանել: Գենետիկայի բնագավառում այն ​​օգնում է հաջորդականությանը և մեկնաբանության գենոմներին և դրանց դիտարկվող մուտացիաները: Այն դեր է խաղում կենսաբանական գրականության տեքստում հանքարդյունաբերության և կենսաբանական տվյալների մշակման և հարցման կենսաբանական և գենային օնոլոգիայի զարգացման մեջ։ Այն նաև դեր է խաղում գենների և սպիտակուցների արտահայտման և կարգավորման վերլուծության մեջ: Կենսաինֆորմատիկայի գործիքները օգնում են համեմատել գենետիկ և գենոմիկական տվյալների և ավելի ընդհանրապես մոլեկուլային կենսաբանության էվոլյուցիոն կողմերի պատկերացումներում: Ավելի ինտեգրացիոն մակարդակով այն օգնում է վերլուծել և կատալոգագրել կենսաբանական ուղիները և ցանցերը, որոնք համակարգերի կենսաբանության կարեւոր մասն են կազմում: Կառուցվածքային կենսաբանության մեջ այն օգնում է ԴՆԹ[2]-ի, ՌՆԹ[3]-ի, սպիտակուցների մոդելավորման և մոդելավորման, ինչպես նաև կենսամակարդակային փոխազդեցությունների վրա։

Պատմություն[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

Պատմականորեն, տերմինը բիոանֆորմատիկան չի նշանակում, թե ինչ է նշանակում այսօր: Պաուլիեն Հոգեվեգը[4] և Բեն Հեսպերը 1970-ական թվականներին փորձել են անդրադառնալ բիոտիկական համակարգերում տեղեկատվական գործընթացների ուսումնասիրությանը: Այս սահմանումը բնութագրեց բիոինֆորմատիկա որպես կենսաքիմիայի զուգահեռ դաշտ (կենսաբանական համակարգերում քիմիական պրոցեսների ուսումնասիրություն):

Գենետիկական նյութերի հաճախականությունները հաճախ օգտագործվում են բիոինֆորմատիկայում և հեշտ է կառավարել համակարգիչները, քան ձեռքով:

Համակարգիչները մոլեկուլային կենսաբանության մեջ կարևոր էին, երբ սպիտակուցային հաջորդականությունը հասանելի դարձավ 1950-ականների սկզբին Ֆրեդերիկ Սանգերը ինսուլինի հաջորդականությունը որոշելուց հետո: Համեմատելով բազմակի հաջորդականությունները ձեռքով դուրս եկան անարդյունք: Այդ դաշտում ռահվիրա էր Մարգարետ Օկլեյ Դայհոֆը: Նա կազմեց առաջին սպիտակուցային հաջորդականության տվյալների բազայից մեկը, որը սկզբում հրապարակվեց որպես գրքեր և ստեղծեց հաջորդականության հավասարակշռման և մոլեկուլային էվոլյուցիայի մեթոդներ: Կենսաինֆորմատիկայի մեկ այլ վաղ ներդրողը եղել է Էլվին Ա. Կաբատը[5], որը 1970 թ. Կենսաբանական հաջորդականության վերլուծություն է կատարել 1980 թ. և Թի Թու Վուի հետ համընդհանուր ծագման հակաբորբոքային ծավալներով:

Կոնֆերանսներ[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

Կան մի քանի խոշոր կոնֆերանսներ, որոնք վերաբերում են բիոինֆորմատիկային: Հատուկ ուշագրավ օրինակներից են Մոլեկուլային կենսաբանության ինտելեկտուալ համակարգերը (ISMB), Հաշվողական կենսաբանության եվրոպական կոնֆերանսը (ECCB) եւ Հաշվողական մոլեկուլային կենսաբանության հետազոտություն (RECOMB):

Ծանոթագրություններ[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

  1. «Bioinformatics»։ Coursera (անգլերեն)։ Վերցված է 2019-01-08 
  2. «Բջիջն՝ իր ԴՆԹ-ով, կենդանի գրադարան է»։ JW.ORG։ Վերցված է 2019-01-08 
  3. «ՌՆԹ»։ www.doctors.am։ Վերցված է 2019-01-08 
  4. «Paulien Hogeweg - Informatic processes in biotic systems: multilevel evolution»։ Institute of Biodynamics and Biocomplexity (en-US)։ Վերցված է 2019-01-08 
  5. «Elvin Kabat»։ geni_family_tree (en-US)։ Վերցված է 2019-01-08 

Գրականություն[խմբագրել | խմբագրել կոդը]

  • Luke Alphey - DNA Sequencing: From Experimental Methods to Bioinformatics։
  • Gil Alterovitz and Marco R. Ramoni - Systems Bioinformatics: An Engineering Case-Based Approach։
  • Sophia Ananiadou and John McNaught - Text Mining for Biology and Biomedicine։
  • Teresa Attwood, David Parry-Smith - Introduction to Bioinformatics։
  • Kenneth Baclawski and Tianhua Niu - Ontologies for Bioinformatics։

Արտաքին հղումներ[խմբագրել | խմբագրել կոդը]